Biogeography
2023-02-12
1 / 1
Biogeography
Extend Bayesian Skyline Plot (EBSP)
2020-03-31
EBSP^[Heled J, Drummond AJ (2008) Bayesian inference of population size history from multiple loci. BMC Evolutionary Biology, 8, 289.] 是一种常用的种群历史动态推算方法，常用于处理 RAD-seq 所得的次世代测序 SNP 数据。RAD-seq 可得到大量的基因位…
R
用 R 下载 GBIF 数据
2020-02-10
R 程辑包 rgbif 可以非常方便地从 GBIF (Global Biodiversity Information Facility) 数据库中以物种、属、科等信息导出想要的数据。参见rgbif tutorial。 library(rgbif) library(dplyr) library(sf) library(spData) library(tmap) library(purrr)…
Biogeography
中国与日本的生物地理学——以动物区系为例
Bin Ye
/
2019-09-16
日本岛屿起源于东亚大陆边缘的增生棱柱（accretionary prism），在中中新世（mid-Miocene）形成破碎的岛屿，一部分与西伯利亚远东相关的岛屿即日本东北部，与另一部分与中国相联系的岛屿即日本西南部，以所谓的“双开门”过程（Otofuji et al. 1985），自中新世以来，约2100-1100万年前这一期间，日本东北部已绕垂直轴逆时针旋转47°，日本西南部也逆时针旋转…
